Issu des rangs de l'AS Saint-Médard, Jean-Paul Dupont signa aux Girondins de Bordeaux une fois devenu sénior. Il fut longtemps cantonné à l'équipe des amateurs. Mais secoué par Bernard Michelena, alors entraîneur de la D3, et se consacrant enfin exclusivement au football, il fut lancé, à 26 ans, dans le grand bain, en août 1972, lors d'un déplacement à Ajaccio, par le nouvel entraîneur des Girondins, Pierre Phelipon.

À la tête d'un effectif chamboulé, l'ancien technicien du PSG fit débuter de nouveaux joueurs comme Dupont, Goubet, Gallice A. ou Fraunié. Jean-Paul Dupont disputa quelques autres matches durant cette saison-là. En 1973-1974, Pierre Phelipon l'aligna à plusieurs reprises jusqu'à son limogeage, en février.

Son successeur André Menaut ne lui offrit qu'un petit quart d'heure de jeu jusqu'à la fin de la saison.

En 1974, il retourna à Saint-Médard-en-Jalles et travailla comme poudrier à la SNPE.