Débutant le football dans le petit club charentais de l'OFC Ruelle, François Dubourdeau fut ensuite formé à l'AS Angoulême. Il franchit tous les échelons sous les couleurs du club charentais, des pupilles jusqu'à l'équipe première en National.

Ne fréquentant pas de centre de formation, il crut néanmoins que son heure était arrivée quand les Girondins firent appel à lui en 1999.

Recruté comme 3ème gardien derrière Ramé et Richert, il évolua avec l'équipe de CFA. Mais une fracture au bras puis des relations détériorées avec Jean-Louis Garcia, l'entraîneur de la réserve, le poussèrent sur la touche.

Proche de raccrocher les gants, il retourna s'entraîner à Angoulême avant de rejoindre le FC Pau et de reprendre goût au football. En décembre 2001, sa carrière prit une nouvelle orientation puisqu'il réussit un essai à Motherwell. Il défendit ensuite les cages de clubs écossais, anglais ou américains de seconde zone.