Recruté en qualité de stagiaire en même temps que son coéquipier palois, André Altuzarra, Roger Lissarague ne prit part qu'à un seul match avec l'équipe professionnelle des Girondins de Bordeaux. Lors de l'épopée qui conduisit les marine et blanc en finale de la Coupe de France 1964, il participa à une seule rencontre lors des tours précédents.

Il quitta le club à l'intersaison suivante, en direction d'Albi, puis de Toulouse, de Limoges et de Villemur.