Remarqué sous le maillot du Bordeaux EC, notamment en éliminant en 1943 le Stade Rennais en Coupe de France, Jacques Fraigneau revêtit le maillot frappé du Scapulaire en 1947, en Deuxième division.

Il resta quatre saisons aux Girondins. Il occupait un rôle de remplaçant et ne connut pas la chance de fouler les pelouses de Première division quand les Girondins devinrent champions en 1950.