Membre de la fameuse équipe des Minots, Jean-Charles De Bono participa au sauvetage de l'Olympique de Marseille quand, en avril 1981, l'équipe réserve remplaça lors des 7 dernières journées du championnat de D2 les professionnels victimes d'un licenciement économique et évita une relégation en D3. Il figura par la suite dans l'équipe qui fit remonter Marseille en D1 en 1984.

Il ne parvint pas à se faire une place au soleil à Marseille et signa en 1985 aux Girondins, en même temps que son coéquipier Marc Pascal. Arrivé dans une équipe championne de France, il n'eut pas plus de temps de jeu.

La seconde saison, il fut même relégué en équipe réserve. Il quitta les Girondins pour Bastia, puis revint terminer sa carrière dans les rangs amateurs de l'US Endoume.