Venu du Stade Montois qui évoluait en Troisième division, Jean-Bernard Brunet signa un contrat de stagiaire professionnel aux Girondins de Bordeaux en 1970. Il ne resta qu'une seule saison sous le maillot marine et blanc avant de poursuivre sa carrière dans le club du FC Barpais.

Il mena une carrière de professeur d'éducation physique avant de devenir CTD de la Ligue d'Aquitaine au début des années 90.

Il devint ensuite directeur du centre de formation du FC Lorient avant de revenir en Gironde occuper le poste d'intendant au centre de formation des Girondins de Bordeaux (2010-2012).